Muzium Lukut ini dibina oleh Jabatan Muzium Malaysia (dahulunya dikenali sebagai Jabatan Muzium dan Antikuiti) dengan kerjasama kerajaan Negeri Sembilan Darul Khusus dengan tujuan untuk menyebarkan maklumat dan bukti sejarah mengenai Lukut khususnya.

Ia juga berperanan mengimbas kembali sejarah kegemilangan Lukut serta tokoh-tokohnya dalam peristiwa sejarah negara untuk ditatapi generasi seterusnya. Ia juga menjadi arena menonjolkan elemen-elemen penting pertalian Lukut dengan senario politik di sekelilingnya bagi memperlihatkan fungsi dan kehebatan Kota Lukut sebagai kubu pertahanan yang melambangkan keunikan senibina tamadun Melayu. Selain itu, muzium ini menjadi tempat memelihara dan mengumpul sejarah kebudayaan negara termasuk artifak, dokumen dan monumen serta lain-lain tinggalan Kota Lukut untuk terus dipelihara dan disimpan.